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今日は午前中にカマバチ科全主要属の形態データとり.主に前脚の数値データの抽出.Bocchus beckeriといわれていた個体にカマサイズの2型がみられる事を発見.現状ではサンプルが少ないので見なかったことにしよう.しかし,雄交尾器では確実にAphelopinae亜科と類縁関係がありそうにみえるが,雌形態でどこまでその傾向が指示されるだろうか.

昼前に好青年となってしまった井村が来る.預かっていた標本等を渡す.会社の上司も挨拶にいらした.

午後からも少しデータをとり,多型解析の方へシフト.アミノ酸翻訳がうまくいっていない箇所がいくつか見つかってしまい,波形データを見直す必要が出てきた.非同義置換が多型の多いクロハラだけで出ているのも気になる.明日午前中はアライメント再検討.種間でindelがどうしても出てきてしまうため,どう書いたものか途方に暮れる.面倒な多型ではあるが,アライメント精度さえ高ければ個体群識別が可能なくらい情報を持っている場合もあるらしい.

Ohshima, I & Yoshizawa, K (2011) The utility of indels in population genetics : The Tpi intron for host race genealogy of Acrocercops transecta (Insecta: Lepidoptera). Molecular Phylogenetics and Evolution, 59(2): 469-476
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